Fils du peintre Kikoine et peintre lui-même, Jacques Yankel offre son exceptionnelle collection de tableaux naïfs et populaires. Le poétique collège du XVIIème siècle accueille ces oeuvres mais aussi le rare cabinet des curiosités de Bresse et les regards de peintres remarquables sur les mondes exotiques (R. Nivelt et H. Farey).
Les artistes contemporains "en marge" y déposent leurs oeuvres ainsi que les peintres ayant séjourné dans le Tonnerois tels que Kikoine, Kremègne, etc.

Les collections regroupent le fonds ancien du musée municipal comprenant des séries paléontologiques et numismatiques (legs de Bresse, 1873). En 1987 puis 1988, une donation faites par Yankel et gérée par l'Association des Amis du Musée d'Art Naif de Noyers est venus enrichir ce noyau primitf d'une centaine d'oeuvres d'art naif, brut et populaire (Bauchant, Bombois, Vivin...).

Cette donation fut complété, en 2001, par un dépôt du Fonds National d'Art Contemporain qui permet de découvrir une remarquable séries d'oeuvres antifascistes de Déchelette, qui font le procès du fascisme et du nazisme.

Et en 2005, le Conseil Général de l'Yonne qui dépose 60 toiles d'art naïf de la collection de Jean-Marc Luce, ami de Yankel et collectionneur averti.

Et, 120 ex-voto sont exposés depuis quelques années : 60 de la collection Jacques Lagrange confiée au musée en 2004 par Madame Moreau-Lalande et 60 de la collection Jeannine et Jacques Geyssantt prêtée depuis 2006.

Le musée présente également une donation qui relève de l'art populaire d'Europ du sus, d'Asie et d'Amérique latine, et se nourrit de milliers d'objets amassés par Jacqueline Selz et Yvon Taillandier.

La collection de Serge Moreau avec plus de 650 boîtes lithogrpahiées.

"Le monde villageois et rêvé" de Albert Niedzviedz, miniatures en terre cuite peinte.